cmp package

Subpackages

• cmp.bidsappmanager package
  • Subpackages
    • cmp.bidsappmanager.gui package
      • Submodules
        • cmp.bidsappmanager.gui.bidsapp module
        • cmp.bidsappmanager.gui.config module
        • cmp.bidsappmanager.gui.globals module
        • cmp.bidsappmanager.gui.handlers module
        • cmp.bidsappmanager.gui.principal module
        • cmp.bidsappmanager.gui.qc module
        • cmp.bidsappmanager.gui.traits module
    • cmp.bidsappmanager.images package
    • cmp.bidsappmanager.pipelines package
      • Subpackages
        • cmp.bidsappmanager.pipelines.anatomical package
        • cmp.bidsappmanager.pipelines.diffusion package
        • cmp.bidsappmanager.pipelines.functional package
    • cmp.bidsappmanager.stages package
      • Subpackages
        • cmp.bidsappmanager.stages.connectome package
        • cmp.bidsappmanager.stages.diffusion package
        • cmp.bidsappmanager.stages.eeg package
        • cmp.bidsappmanager.stages.functional package
        • cmp.bidsappmanager.stages.parcellation package
        • cmp.bidsappmanager.stages.preprocessing package
        • cmp.bidsappmanager.stages.registration package
        • cmp.bidsappmanager.stages.segmentation package
  • Submodules
    • cmp.bidsappmanager.project module
• cmp.cli package
  • Submodules
    • cmp.cli.cmpbidsappmanager module
    • cmp.cli.connectomemapper3 module
    • cmp.cli.connectomemapper3_docker module
    • cmp.cli.connectomemapper3_singularity module
    • cmp.cli.showmatrix_gpickle module
    • cmp.cli.visualize_eeg_pipeline_outputs module
• cmp.config package
• cmp.pipelines package
  • Subpackages
    • cmp.pipelines.anatomical package
      • Submodules
        • cmp.pipelines.anatomical.anatomical module
    • cmp.pipelines.diffusion package
      • Submodules
        • cmp.pipelines.diffusion.diffusion module
    • cmp.pipelines.functional package
      • Submodules
        • cmp.pipelines.functional.eeg module
        • cmp.pipelines.functional.fMRI module
  • Submodules
    • cmp.pipelines.common module
• cmp.stages package
  • Subpackages
    • cmp.stages.connectome package
      • Submodules
        • cmp.stages.connectome.connectome module
        • cmp.stages.connectome.eeg_connectome module
        • cmp.stages.connectome.fmri_connectome module
    • cmp.stages.diffusion package
      • Submodules
        • cmp.stages.diffusion.diffusion module
        • cmp.stages.diffusion.reconstruction module
        • cmp.stages.diffusion.tracking module
    • cmp.stages.eeg package
      • Submodules
        • cmp.stages.eeg.esi module
        • cmp.stages.eeg.preprocessing module
    • cmp.stages.functional package
      • Submodules
        • cmp.stages.functional.functionalMRI module
    • cmp.stages.parcellation package
      • Submodules
        • cmp.stages.parcellation.parcellation module
    • cmp.stages.preprocessing package
      • Submodules
        • cmp.stages.preprocessing.fmri_preprocessing module
        • cmp.stages.preprocessing.preprocessing module
    • cmp.stages.registration package
      • Submodules
        • cmp.stages.registration.registration module
    • cmp.stages.segmentation package
      • Submodules
        • cmp.stages.segmentation.segmentation module
  • Submodules
    • cmp.stages.common module
• cmp.viz package
  • Submodules
    • cmp.viz.reports module

Submodules

• cmp.parser module
• cmp.project module